體系文件編制完成后，將進入試運行階段，其目的是通過該過程檢驗HSE管理體系文件的有效性和協調性。在此階段中，企業應加強管理力度，通過實施HSE管理體系手冊、程序文件和兩書一表，充分發揮體系本身的各項功能，及時發現問題，找出問題的根源，糾正不符合，以期進一步完善和貫徹HSE管理體系文件。健全的HSE管理體系在運行中應做到：事事有人管，人人有專責，辦事有程序，活動有資源，檢查有標準，問題有處理。

在HSE管理體系試運行的過程中，要重點抓好以下幾個方面的工作。