各類企事業單位、公司、政府機關，無論是它們的結合體或部份（以下統稱為組織），無論是何種文化背景和所有制性質，無論它們處于何種環境表現水平和環境管理水平，都可按ISO14001標準的規范要求實施適用于組織自身的環境管理體系（以下簡稱為EMS）。EMS是個動態的，需不斷發展和完善的體系，建立程序與其運作模式沒有本質的區別，都遵循著名的"策劃－實施－檢查－改進"管理循環理論（簡稱PDCA循環），通常可分解為如下六個階段和過程。

　　一、領導決策與準備：EMS是組織全面管理體系的組成部分，環境保護對于組織具有深遠的戰略意義，EMS的建立與實施需要投入人、財、物等各種資源，因此，必須首先得到最高管理者（層）的明確承諾和支持。最高管理者應任命環境管理者代表，授權其負責建立和維護體系，并向其匯報體系情況。組織應組建一支精干的EMS工作組，在管理者代表的領導下，在通過國際標準、環境知識、環境法律等培訓后，即可著手建立體系。

　　二、初始環境評審：初始環境評審是組織明確環境管理現狀的手段，其結論是建立EMS的技術基礎和前提條件。管理者代表和工作組應精心策劃和實施評審，充分調動發揮各部門的積極性和作用，廣泛收集信息資源，編制評審報告。初始環境評審的內容主要包括：
　　（1）明確組織應遵守的與環境相關的法律法規標準及其他要求，對組織的環境表現進行評價，確定改進的需求和可能性；
　　（2）利用產品生命周期分析的思想明確組織產品、活動和服務中可以控制和可能施加影響的環境因素，評價出重要環境因素，以作為改進和控制的對象；
　　（3）收集、分析和評審組織現有與環境相關的管理制度、職責、程序、慣例等信息資源和文件，與ISO14001標準要求對照，確認有益合理成份，以作為EMS的基礎。（4）對以前的環境條件和市場信息進行分析評審，以避免環境風險，爭取競爭優勢。

　　三、體系策劃與設計：依據評審結論，結合組織戰略和實力，組織應進行如下策劃活動：
　　（1）由最高管理者制定和簽署環境方針，環境方針應明確承諾遵守法律法規，承諾持續改進和污染預防，應指明總體環境目標指標的架構；
　　（2）制定盡可能量化和分層次的環境目標指標，應符合環境方針的承諾，考慮重要環境因素、法律法規要求、技術和財務自行性及相關方的要求；
　　（3）制定確保目標指標實現的環境管理方案，明確職責、時限和方法措施；
　　（4）建立和明確環境管理組織機構和職責權限。

　　四、EMS文件編制：與質量管理體系相似，EMS遵循如下思路，"寫出組織要做的，做組織所寫的，記組織已做的"。管理者代表應領導和策劃EMS文件的編寫過程。應充分利用初始環境評審的結論，對現有體系及其文件進行徹底的清理，取其有用合理成份（包括ISO9000體系中相關文件的采用），將無用文件予以失效處置。組織可采用ISO10013標準推薦的模式編制EMS文件。EMS文件可分為手冊、程序文件、作業文件、報告記錄四個層次。除了滿足ISO14001標準要求，EMS應保障文件的適用性、有效性，可操作性以及文件間及不同活動和職責間的接口關系。通常手冊和程序文件由EMS工作組草似，第三層次的作業文件由相關部門的專業人員編制。各類文件有必要經過文件使用者的充分評審，甚至讓使用者代表參予編寫過程。　

　　五、EMS試運行：EMS試運行與正常運行無本質區別，均應按EMS文件去實施，并記錄運行結果。所不同的是，EMS剛建立時需改進的問題相對較多，應通過體系自身運作完善。EMS文件一旦編制完成，
　　（1）最高管理者應親自啟動EMS，各層次管理者應策劃各部門的EMS運作；
　　（2）對各層次的EMS文件使用者實施分層次的EMS文件培訓；
　　（3）對ISO14001EMS實施全面運作；
　　（4）對于急于實施第三方認證的組織，應加強動作力度，以便有充分證據證實實施EMS的成效。

　　六、EMS內部審核和管理評審：EMS經過一段時期試運行，管理者代表應組織培訓合格的內審員實施內部審核。內審應按標準要求有計劃地、程序化文件化地進行。應審核EMS文件的完整性、一致性、與ISO14001標準的符合性，審核環境管理活動是否滿足EMS文件有關計劃安排和標準要求，審核EMS是否得到正確實施和保護，審核結果應形成文件并報送最高管理者。此后，最高管理者應組織中層管理者對內審結果、目標指標完成情況、EMS改進的可能性和需要等進行評審，以確保EMS持續適用，充分和有效。

　　至此，EMS已完成一輪PDCA循環。組織在實施改善的同時，EMS進入了新一輪循環。打算進行認證的組織此時便可委托認證機構實施第三方認證審核了。