1. 消毒供應中心工作人員工作時應嚴格遵守“標準預防”的原則：進入各工作區域要按規定更衣、更鞋、戴圓帽；去污區工作人員應加戴外科口罩，穿專用鞋，抗濕罩袍或圍裙、戴橡膠手套或防刺穿乳膠手套，戴防護面罩或護目鏡；去污區安置有洗眼裝置。
2、手衛生防護：工作人員應嚴格掌握洗手及手消毒指征，做好自我防護工作。
3、銳利器械的防護：工作人員在進行器械分類時，注意力應集中，動作敏捷，銳利器械和普通器械應分開放置清洗，避免在清洗過程中誤傷工作人員，同時防止利器相互碰撞，造成刃面受損。如不慎被銳利器械刺傷，應做好銳器傷應急處理。
4、物理因素的防護：消毒員在滅菌過程中應嚴格遵守操作規程，穿長袖工作服，戴清潔或滅菌的帆布手套進行滅菌物品的裝載和卸載工作，另外科室的蒸汽管道應有保溫防護，以免工作人員燙傷。工作人員在操作煮沸消毒器和干燥恒溫箱時應嚴格遵守操作規程，必要時戴防燙手套；如不慎燙傷，科室配有燙傷膏予以緊急處理。
5、化學因素的防護：工作人員在使用和配制對皮膚有刺激的消毒液清洗劑、除銹劑時，必須戴手套、口罩、護目鏡，必要時戴防護面罩。
6、免疫防護：消毒供應中心工作人員應每年進行輸血前七項檢查，根據化驗結果及時進行疫苗接種并定期檢查，提高機體的免疫力，防止院內感染的發生。