化學實驗室經常會產生一些有毒的氣體、液體和廢渣需要處理，如果直接排放會污染空氣和水源，造成環境污染，實驗室本身也是一個密閉空間，“三廢”物質未經處理直接排放也會給實驗工作人員的身心健康帶來危害。因此，實驗室的廢氣、廢液、廢渣必須經過處理后，才能排棄，嚴禁將濃酸、濃堿廢液和含有鉻、汞、鉛等重金屬元素的廢液以及不能溶解的固體物質倒入水池，以防堵塞和腐蝕管道。
1、實驗室廢氣的處理
① 產生有毒廢氣的實驗應在通風柜內進行，通過排風設備將有毒氣體排出室外。
② 氣相色譜儀器檢測器出口的廢氣應通過萬向吸氣罩及時排除實驗室。
③ 煤質分析室各類分析儀器（如工分儀、測硫儀、元素測定儀、灰熔點測定儀）和原子吸收儀產生的廢氣應通過原子吸收罩及時排出實驗室。
④ 氣體分析實驗完成后，應將取樣用的球膽、鋼瓶等取樣容器放在通風柜內，防止容器內剩余的氣體滲漏到室內。
⑤ 對有毒氣體實驗應改進試驗裝置，采用閉路、循環等裝置避免有毒氣體泄漏。
2.實驗室廢液的處理
① 一般的酸堿和不含重金屬離子的鹽類廢液，用酸堿中和的辦法，將pH調整到6～8，方可倒入水槽排除。
②含有氰的廢液應及時處理，可用高錳酸鉀在堿性條件下分解，或者NaCLO分解成CO2和N2后排入水槽。
③ 含有鉻、汞、銀、鎘、銅、錳等重金屬離子的廢液，用堿液沉淀，加絮凝劑沉淀，達標后排放。
④ 若不小心將金屬汞（水銀）灑落在實驗室地面上，必須用吸管、毛筆或者硝酸汞溶液浸漬過的薄銅片將所有汞滴撿起，收集于適當的瓶子中，用水覆蓋起來。灑落過汞的地面應撒入硫磺粉，將灑落區覆蓋一段時間，使其生成硫化汞，在設法掃凈；也可噴灑20%的三氯化鐵溶液，讓其自行干燥后再行清掃。
3.實驗室廢渣的處理
對有毒的廢渣應及時處理，一般固體，可集中定期處理；有價值的可以進行回收處理；少量無價值的固體可焚燒或者采用深埋的方式處理。