2、部門產出法。該方法的核心是根據部門產出率(產品和服務)與生態系統安全度的相關性來測定生態安全，是一種間接度量生態安全的方法。一般來講，產出水平與生態系統聯系緊密的部門(如農業、畜牧業、漁業等)，其產出率與生態系統的安全度呈正相關關系。這種方法的缺陷是：一是人們在度量部門產出率時，往往僅僅關注直接的產出成果而忽視了產出本身對生態系統的其他潛在或顯在的外部負效應

　　(如生物多樣性減少、土壤流失、環境質量退化等)；二是產出率下降肯定說明生態系統的安全度降低，但產出率提高則未必一定說明生態系統的安全度相應提高，因為我們可以通過某些技術手段來提高產出率，但卻可能因此失去其他一些更為重要甚至不可逆的產品和服務。生態安全評價必須滿足相互沖突的多個目標，并考慮生態環境問題之間錯綜復雜的關系，所以用部門產出法來評價生態安全顯然只具有部分可用性。

　　3、最優化綜合評價法。最優化綜合評價法的基本思想是實現多目標組合的最優化，據此判定生態系統的安全狀態。目標設定既包括生態系統的直接生產能力和間接生產能力，也包括生態系統在提供產品和服務時系統間的相互影響進程。該方法的特點是：

　　(1)克服了部門產出法的缺陷，提供了考察生態系統內在聯系的框架，既關注生態系統的直接生產能力，同時也不放棄生態系統增加綜合效益的機會；(2)能夠把那些不能通過市場價值體現的產品和服務納入一個統一的框架進行評價和度量；(3)拓寬了傳統的生態系統的管理邊界，強調系統性，意識到了生態系統功能具有整體性，因而必須進行整體評價、整體管理而不是分別評價和分而治之；(4)拓寬了生態系統評價和生態系統管理的時間尺度和空間尺度；(5)能夠整合社會、經濟和環境等多方面的信息，因而能將人類需求與生態系統的生物能力緊密地聯系起來；(6)把生態系統提供產品和服務的過程視為一個安全生態系統的自然過程而不是作為生態系統自身的終結，重視生態系統的生產潛力，因而維護了未來世代人的發展機會和權利。

　　4、千年生態系統評價(MEA)。千年生態系統評價作為一個大型國際合作項目，目的在于描述并評價人類所居住的這個星球的健康狀況。千年生態系統評價包括三個部分的內容：①全球部分。目的在于為未來的評價建立一個基線，建立綜合的生態系統評價的方法，提高公眾對生態系統產品和服務重要性的認識；②區域、國家和地方部分。目的在于幫助促進更加廣泛的使用綜合評價方法，幫助發展這種評價所需的方法和模擬工具，直接提供作用于區域管理和決策的信息；③能力建設。目的在于使MEA開發出來的信息、方法和模擬工具能夠在全世界的國家和國家以下各級的評價進程中發揮作用。

　　三、構建生態安全評價指標體系的總體思路

　　同其它的指標體系硏究一樣，生態安全評價指標體系也需要解決度量什么和如何度量的問題，所以，生態安全指標體系需要的信息必須是可得的，所建立的指標體系必須是有意義的，對決策者和生態系統的管理者具有切實的指導作用，對廣大社會公眾具有教育意義以及對公眾的行為選擇和行為調整具有指導意義。從生態安全的內涵上看，生態安全評價指標體系、應當包括國土安全評價指標體系、水安全評價指標體系、森林安全評價指標體系、濕地安全評價指標體系、草地安全評價指標體系、海洋安全評價指標體系和大氣安全評價指標體系。
　　但是，生態安全評價是一項非常復雜的系統工程，生態安全評價指標體系究竟應當包含哪些具體的指標，則需要多學科的交叉合作。從指標設計的宏觀思路上看，不僅要反映生態系統各子系統的安全狀態，還要反映各子系統之間的相互關系和相互影響以及行為主體的安全意識、應對能力和應對措施的效率，因此可以考慮按照“狀態一關系一反應”框架構建三個指標模塊一狀態指標模塊、關系指標模塊和反應指標模塊。生態安全的評價是一個極富挑戰性的課題，這除了生態系統本身的復雜性外，還受到人類自身知識缺陷和認識邊界的限制，生態安全評價也不是某個單一學科能夠解決和承擔得起的，它需要不同學科的交叉、融合以及科學家的通力合作才有可能取得比較滿意的成果。具體到生態安全評價問題，還需要進一步解決很多問題，包括生態安全因子的確認與計量、生態安全指標的篩選和生態安全指標體系的構建、生態安全(包括國土安全、水安全、濕地安全、生物多樣性安全、草地安全、森林安全、海洋安全、大氣安全等)指標閥值(安全邊界)的確定、生態安全預警系統的建立等等。》