醫院污水主要由醫療廢水和醫護人員的生活廢水組成，其中含有大量的病原體、微生物、致病菌也可能存在精神、麻醉廢棄藥品不小心混入到廢水中的情況。（正常情況是精神、麻醉等藥品和醫療廢物單獨進行收集、處理）；應加強醫院污水處理過程的安全防護工作，避免對人群健康和周邊環境產生不利影響。應采取以下幾方面措施：
    1.采用技術先進、經濟合理醫院廢水處理工藝，加強設備維護檢修，保證污水處理設備運行良好；
    2.優化工程設計滿足醫院污水處理水量和處理規模要求。
    3.醫院污水處理設施設置防滲層、周邊設置事故池，在主要處理設備周邊設置圍堰，設置能夠切斷和轉換醫院廢水處理裝置與外環境聯系的裝置，防止因設備故障和其他原因造成污水外溢污染地表水和地下水。
    4.加強對水處理設施進水、出水、的水質、水量的監測，保證達標排放。
    5.設立污水處理設施管理制度，專人管理。