針對巷道工程安全穩定性問題，基于巖石工程系統（RES）理論，提出了全耦合分析方法。根據全耦合分析思想及流程，并在收集的樣本的基礎上，應用神經網絡編碼法建立了地下巷道工程的綜合交互作用矩陣，認為巖體結構、開采深度和地下水為主要影響因素，并且給出了以開采深度為主要作用的總體正反饋機理路徑。最后，應用全耦合方法對沙曲礦進行穩定性分析及優化設計，現場應用及監測結果表明全耦合分析法在巷道安全評價中具有較高意義。